Где те девушки, что были бы добры к отаку?

Главным героем аниме «Где те девушки, что были бы добры к отаку?» является парень-отаку по имени Такуя Сэо. В классе он всегда сидит позади ярких девочек, Итидзи и Аманэ, которые принадлежат к другой «лиге». Однажды их миры сталкиваются, поскольку одолженный ластик стал причиной для разговора. Главный герой случайно рассказывает о своей любви к аниме, а Аманэ внезапно поправляет название одного из них, отрицая то, что она тоже отаку. Так, между героями завязываются сначала дружеские, а потом и романтические отношения.